Управление – аппарат директора

начальник отдела планирования и обеспечения деятельности руководства
начальник организационно-инспекторского отдела

Управление кадров и противодействия коррупции

заместитель начальника управления – начальник отдела противодействия коррупции
начальник отдела подбора и развития персонала
консультант отдела противодействия коррупции
ведущий специалист-эксперт отдела противодействия коррупции
старший специалист 1 разряда отдела эксплуатации объектов и снабжения

Управление эксплуатации информационных систем

консультант отдела внедрения и сопровождения программных систем

Управление развития информационных систем

консультант отдела управления ИТ-проектами
главный специалист-эксперт отдела информационно-методического обеспечения
заместитель начальника отдела программного обеспечения
главный специалист-эксперт отдела программного обеспечения

Управление по противодействию отмыванию доходов 

заместитель начальника отдела первичной проверки
ведущий консультант отдела инициативных финансовых расследований
главный специалист-эксперт отдела инициативных финансовых расследований

Управление по работе с бюджетной сферой

начальник отдела мониторинга госконтрактов
советник отдела операционного анализа
специалист 1 разряда отдела сводного анализа

Управление организации надзорной деятельности

заместитель начальника управления
ведущий специалист-эксперт отдела отчетности и планирования проверок
советник отдела взаимодействия с надзорными органами и частным сектором
специалист-эксперт отдела оценки эффективности

Управление международных связей

специалист-эксперт отдела организационного обеспечения международной деятельности
консультант отдела международных экспертов

Управление по противодействию финансированию терроризма 

специалист-эксперт отдела финансового анализа и инициативных финансовых расследований
главный специалист-эксперт отдела финансовых расследований

Управление координации и взаимодействия

заместитель начальника управления – начальник отдела координации работы на приоритетных направлениях деятельности
начальник отдела координации межрегиональных финансовых расследований
консультант отдела координации межрегиональных финансовых расследований
заместитель начальника отдела координации работы на приоритетных направлениях деятельности
консультант отдела координации работы на приоритетных направлениях деятельности
специалист-эксперт отдела координации работы на приоритетных направлениях деятельности
главный специалист-эксперт отдела по взаимодействию с органами государственной власти

Управление макроанализа и типологий

начальник отдела макроаналитических исследований и оценки рисков
консультант отдела макроаналитических исследований и оценки рисков

Юридическое управление

консультант международно-правового отдела
заместитель начальника нормативно-правового отдела
заместитель начальника отдела правового обеспечения административной практики и межведомственной координации
консультант отдела гражданско-правовой работы и правового обеспечения финансово-хозяйственной деятельности

Финансово-экономическое управление

заместитель начальника управления